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基于DNA條形碼的桑黃真菌分子鑒定

徐鑫; 邊勇; 陳哲; 孫悅; 劉子璐; 胡渤洋; 武揚(yáng); 張國慶 北京農(nóng)學(xué)院生物科學(xué)與工程學(xué)院/農(nóng)業(yè)部都市農(nóng)業(yè)北方重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 北京102206; 北京出入境檢驗(yàn)檢疫局檢驗(yàn)檢疫技術(shù)中心; 北京101312; 浙江出入境檢驗(yàn)檢疫局; 浙江杭州310016
  • 桑黃
  • 分子鑒定
  • dna條形碼
  • nl
  • its

摘要:DNA條形碼(DNA barcoding)技術(shù)是一種利用生物基因組內(nèi)短遺傳標(biāo)簽進(jìn)行分類鑒定的方法.桑黃自古以來是一種名貴中藥材,而市售桑黃主要依托簡單的形態(tài)鑒定造成混淆眾多.近年來大量研究表明,桑黃類真菌種類至少有7個種,并且其藥效也不盡相同.【目的】為更準(zhǔn)確、高效對桑黃類真菌進(jìn)行鑒定,本研究以采集自西藏、吉林和浙江的3種桑黃子實(shí)體為材料,篩選最佳DNA條形碼與相應(yīng)PCR條件.【方法】利用組織分離獲得3種桑黃純培養(yǎng)菌株,分別編號為1713、1714和HS菌株.利用ITS、NL、rpb1、rpb2和ef1-α等7組DNA條形碼分別對3種桑黃進(jìn)行PCR擴(kuò)增、測序、比對和發(fā)育樹分析,并結(jié)合形態(tài)學(xué)特征,確定其最適DNA條形碼和分類學(xué)地位.【結(jié)果】結(jié)果表明,ITS和NL條形碼對3種桑黃均能夠獲得單一目的條帶;rpb1Y、rpb2B和rpb2Y條形碼特異性低,擴(kuò)增后獲得多個條帶;而rpb1B和ef1-α條形碼均無法獲得條帶.通過多序列比對,結(jié)合形態(tài)分析,確定1713菌株為桑黃纖孔菌(Inonotus sanghuang),而1714和HS菌株均為鮑姆纖孔菌(Inonotus baumii).【結(jié)論】本研究確定ITS和NL為桑黃分子鑒定的最佳DNA條形碼,其PCR最適退火溫度范圍分別為58~59℃和49~50℃,為桑黃真菌快速鑒定提供參考依據(jù).

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