摘要：【目的】通過多個雙孢蘑菇菌株不同發(fā)育階段的差異轉(zhuǎn)錄組分析,為進一步驗證雙孢蘑菇發(fā)育相關(guān)基因及探討其分子機理奠定基礎(chǔ)。【方法】對雙孢蘑菇主栽品種As2796及其親本02、8213,其回交子代W192,以及國外野生菌株ARP159、國內(nèi)野生菌株AgLH830共6個具有重要代表性的菌株子實體原基期、幼菇期、采摘期、開傘期等4個不同發(fā)育階段共24個樣品進行轉(zhuǎn)錄組測序,并與雙孢蘑菇參考基因組序列進行比對,根據(jù)比對結(jié)果進行各基因在不同樣品中的表達(dá)量分析及差異表達(dá)基因識別,發(fā)掘新基因與共同基因的差異表達(dá),并進行各數(shù)據(jù)庫的基因功能注釋。【結(jié)果】結(jié)果共鑒定到10 660個轉(zhuǎn)錄本,發(fā)掘新基因677個,其中237個得到功能注釋。與原基期相比,6個菌株在幼菇期、采摘期和開傘期分別有49、82、73個共同差異表達(dá)基因,其中有13個是相同的基因。【結(jié)論】發(fā)現(xiàn)了一批在雙孢蘑菇子實體不同發(fā)育階段具有顯著差異表達(dá)的基因,篩選出不同菌株不同階段的共有差異基因,對雙孢蘑菇子實體發(fā)育中重要的差異基因進行了注釋與探討。