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一株新型殺鮭氣單胞菌烈性類T4噬菌體Asfd-1的分離鑒定和生物學特性分析

周燕; 袁盛建; 嚴庭瑋; 馬迎飛 中國科學院深圳先進技術研究院合成生物學研究所(籌)定量合成生物學研究中心; 深圳518055; 中國科學院大學; 北京100049; 暨南大學; 廣州510632
  • 殺鮭氣單胞菌
  • 噬菌體治療
  • 生物信息

摘要:噬菌體是自然界中最普遍的生物之一,其專一性裂解細菌的能力在針對耐藥菌感染治療方面具有很大的應用前景。殺鮭氣單胞菌(Aeromonas salmonicide)是水產養殖業中一種主要病原菌,其引發的癤瘡病是一種常見的水產養殖動物疾病,具有高死亡率和高發病率,一旦爆發,將給水產養殖業帶來重大的經濟損失。該研究以殺鮭氣單胞菌MF663675.1為宿主菌,從深圳海鮮市場的污水中,采用雙層瓊脂平板法分離純化得到單個噬菌體,通過電鏡對其表觀形態特征進行觀察,并運用生物信息的方法進一步確定其基因型特征及遺傳分類地位。研究結果表明,分離出的烈性噬菌體命名為Asfd-1,噬菌斑呈圓形,輪廓分明、透明,直徑約1mm。電鏡觀察顯示,Asfd-1具有對稱的二十面體頭部,以及長度為51 nm的收縮尾部。基因組測序和基因對比分析表明,Asfd-1含雙鏈脫氧核糖核酸(dsDNA),全基因組大小為168 962 bp,鳥嘌呤(G)和胞嘧啶(C)所占的比例為41.53%,共編碼263個開放閱讀框和16個轉移核糖核酸(tRNA)序列,Genbank登錄號為MK577502。根據國際病毒分類委員會規定的病毒分類方法,與同源的Aeromonas phage 31 GCA000862645.1和Aeromonas phiSA4GCA002710125.1全基因組對比結果顯示,Asfd-1是新型噬菌體。綜合電鏡觀察結果及系統進化樹分析,Asfd-1屬于肌尾科下的T4噬菌體屬、肌尾噬菌體科、有尾噬菌體目的新成員。該研究可為應用噬菌體治療細菌感染提供進一步的參考。

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