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豬線粒體控制區(qū)微衛(wèi)星(mtMs)變異及其分布特征

蔡原; 姜天團(tuán); 楊巧麗; 王川; 趙生國(guó) 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院; 蘭州730070; 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院; 蘭州730070
  • mtdna
  • 微衛(wèi)星
  • 變異
  • 結(jié)構(gòu)特征

摘要:豬線粒體DNA長(zhǎng)度因D-loop中mtMs序列重復(fù)數(shù)變異而不同。為闡明豬mtMs變異及其在不同群體中的分布特征,本研究對(duì)4個(gè)藏豬群體、八眉豬、煙臺(tái)黑豬及3個(gè)引入豬群體共164個(gè)個(gè)體mtDNA D-loop全序進(jìn)行測(cè)定,并與GenBank中發(fā)表的相關(guān)序列進(jìn)行比對(duì),分析了其中的重復(fù)單元核苷酸變異、重復(fù)次數(shù)及其在各群體間的分布規(guī)律。結(jié)果表明,因重復(fù)單元“5’-TGCGTACACG-3’”第2~4和10位上堿基變異,豬mtMs形成了以其為核心序列的多種重復(fù)單元(R^A~R^G)組成的復(fù)合結(jié)構(gòu),重復(fù)數(shù)介于3~47之間。單一重復(fù)(R^A)組成的mtMs結(jié)構(gòu)在各群體中表現(xiàn)出分布優(yōu)勢(shì),而大多數(shù)復(fù)合結(jié)構(gòu)(R^AR^B)分布在國(guó)外選育群體中。藏豬的mtMs復(fù)合結(jié)構(gòu)多達(dá)8個(gè),R^AR~CR^E為其特有,另有5個(gè)與八眉豬共享。中國(guó)野豬和韓國(guó)地方豬種也有其特有mtMs結(jié)構(gòu)。豐富的mtMs變異和特有結(jié)構(gòu)與長(zhǎng)期適應(yīng)進(jìn)化有關(guān),本研究為地方豬種遺傳資源及適應(yīng)性研究提供了標(biāo)記工具和理論基礎(chǔ)。

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基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)

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