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基于機(jī)器學(xué)習(xí)的RNA編輯位點(diǎn)預(yù)測(cè)方法綜述

冷嘉承; 吳凌云 中國科學(xué)院數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)研究院應(yīng)用數(shù)學(xué)研究所; 管理、決策與信息系統(tǒng)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 國家數(shù)學(xué)與交叉科學(xué)中心; 北京100190; 中國科學(xué)院大學(xué)數(shù)學(xué)科學(xué)學(xué)院; 北京100049
  • rna編輯
  • 高通量測(cè)序
  • 機(jī)器學(xué)習(xí)

摘要:RNA編輯是一個(gè)十分重要的生物細(xì)胞分子機(jī)制。作為轉(zhuǎn)錄后修飾的一步,它可以增加蛋白質(zhì)組學(xué)多樣性,改變轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的穩(wěn)定性,調(diào)節(jié)基因表達(dá)等。RNA編輯失調(diào)會(huì)導(dǎo)致各種疾病,包括神經(jīng)疾病和癌癥。在動(dòng)物中,腺苷到肌苷(A-to-I)的編輯是最普遍的。高通量測(cè)序技術(shù)的進(jìn)步大大提高了在全局范圍內(nèi)檢測(cè)和量化RNA編輯的能力,使得RNA編輯的大規(guī)模全基因組分析變得可行,產(chǎn)生了一系列基于高通量測(cè)序技術(shù)的RNA編輯位點(diǎn)預(yù)測(cè)方法。通過對(duì)這些方法進(jìn)行介紹、總結(jié)和分析,為RNA編輯的進(jìn)一步研究提供一些思路。

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生物信息學(xué)

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