摘要：【背景】除了菌根真菌(Orchid mycorrhizal fungi,OrMF)外,蘭科植物根中還有其它內生真菌,稱為根相關真菌(Root-associated fungi,RAF)。【目的】采用分離培養的方法獲得同一棲息地針葉林和灌木林兩種不同生境西藏杓蘭、黃花杓蘭和無苞杓蘭的RAF菌株,研究其真菌譜系、多樣性和生態功能結構?！痉椒ā繌蔫继m根碎屑中分離RAF,通過總DNA提取、PCR擴增及測序得到ITS(Internaltranscribedspacer)序列;進行系統發育和多樣性分析,并通過NCBI數據庫比對得到相似性最高序列的注釋信息來分析RAF生態學特性。【結果】共分離得到278株RAF,25種OTU類型,包括23個子囊菌門OTU,2個毛霉菌門OTU。RAF物種豐富度分析發現西藏杓蘭的較黃花杓蘭高,不同生境沒有顯著差異;不同杓蘭物種較不同生境的RAF群落分化程度高。生態功能分析顯示25個OTU包括共生型、腐生型和致病型3種營養型,以及外生菌根菌群、植物病原菌群、內生真菌群、動物病原菌群、真菌寄生菌群、杜鵑花類菌根群、未定義的腐生菌群和不確定型8種共位群。【結論】闡明不同生境采集的不同杓蘭中RAF的分布特點和生態功能,為未來研究RAF與杓蘭屬植物的共生關系奠定基礎。