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人參BBM基因全長(zhǎng)cDNA的克隆及生物信息學(xué)分析

李昂; 姬文秀; 陳雙越; 包悅琳; 陳鴿; 金東淳 延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)院; 吉林延吉133002
  • 人參
  • bbm基因
  • 克隆
  • 序列分析

摘要:BBM(BABY BOOM)基因是屬于植物AP2/EREBP基因家族的AP2亞族的轉(zhuǎn)錄因子,已有很多研究表明,過(guò)量表達(dá)BBM基因能夠誘導(dǎo)植物體細(xì)胞胚,是植物體細(xì)胞胚誘導(dǎo)研究中應(yīng)用潛力大的重要基因之一。為利用BBM基因誘導(dǎo)人參體細(xì)胞胚,該試驗(yàn)采用RACE方法克隆了2 291 bp的人參BBM基因全長(zhǎng)cDNA,包含1 998 bp的開放閱讀框(ORF),編碼665個(gè)氨基酸。用其推測(cè)的編碼蛋白序列與擬南芥等植物的BBM基因序列比對(duì)結(jié)果,人參BBM基因中包含euANT2-euANT6、bbm-1等基序,還包含由Linker連起來(lái)的2個(gè)AP2結(jié)構(gòu)域(AP2-R1和AP2-R2),說(shuō)明PgBBM是屬于AP2亞族的轉(zhuǎn)錄因子。與其它植物已知BBM基因構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹顯示,人參BBM基因與煙草、大豆、苜蓿的BBM基因親緣關(guān)系較近,與其它植物的BBM基因的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。

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延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)學(xué)報(bào)

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