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山羊地方性鼻內(nèi)腫瘤病毒重慶株基因組序列分析

沈克飛; 唐達(dá); 楊柳; 徐登峰; 許國(guó)洋; 付利芝; 張素輝 重慶市畜牧科學(xué)院; 重慶402460
  • 地方性鼻內(nèi)腫瘤
  • 基因組
  • 遺傳多樣性

摘要:目的分析山羊地方性鼻內(nèi)腫瘤病毒(enzootic nasal tumor virus,ENTV)重慶株基因組序列。方法對(duì)臨床病例進(jìn)行剖檢、病理學(xué)觀察,提取組織總RNA,進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,對(duì)獲得的ENTV-2基因組序列進(jìn)行測(cè)定及分析。結(jié)果鼻內(nèi)腫瘤在鼻腔后端與鼻甲篩骨黏膜緊密相連,完全阻塞鼻腔,侵入鼻竇,呈灰紅色、乳頭狀,表面覆蓋大量透明黏液。腫瘤細(xì)胞以管狀和乳頭狀結(jié)構(gòu)排列。拼接出1條長(zhǎng)度為7 243 nt的ENTV-2 CQ株基因組序列,約占ENTV-2基因組長(zhǎng)度的96. 2%。該序列與四川ENTV-2的同源性,最高大于97%,與山羊內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒(caprine endogenous retrovirus,CERV)gag(XM018046415CERV)的同源性高于98%,與陜西ENTV-2的同源性為91%~92%,與英國(guó)ENTV-2(AY197548)的同源性為88%。多序列比對(duì)顯示,CQ株gag基因有2處多核苷酸插入,這一序列特征與XM018046415CERV的gag基因相同。除了AY197548ENTV-2單獨(dú)構(gòu)成Ⅱ群外,ENTV-2在羊反轉(zhuǎn)錄病毒進(jìn)化樹(shù)中構(gòu)成Ⅰ群;CQ株與四川ENTV-2構(gòu)成一分支,與陜西ENTV-2構(gòu)成另一分支。結(jié)論該病例為山羊地方性鼻內(nèi)腫瘤(enzootic nasal tumor,ENT),提示其病原可能是1株古老ENTV-2毒株,有遺傳多樣性。

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