摘要：目的:研究頭頸部鱗癌(HNSCC)的轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及潛在關(guān)鍵靶點(diǎn)。方法:利用基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫(GEO)聯(lián)合GEO2R在線工具分析HNSCC與正常黏膜組織的基因表達(dá)差異;利用Clue GO進(jìn)行差異基因功能注釋及通路相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建;基于相互作用基因/蛋白檢索工具(STRING)數(shù)據(jù)庫及Cytoscape軟件構(gòu)建蛋白-蛋白相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò),分析其關(guān)鍵網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)和基因簇,并利用iRegulon插件進(jìn)行轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建并篩選關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子;利用Kaplan-Meier Plotter分析關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子與HNSCC患者預(yù)后相關(guān)性。結(jié)果:和正常黏膜組織相比,HNSCC組織共有168個(gè)基因(66個(gè)上調(diào),102個(gè)下調(diào))發(fā)生顯著變化。這些差異基因與細(xì)胞外基質(zhì)分解、胞外基質(zhì)重塑、IL-17信號通路、膠原代謝過程、胞外基質(zhì)-受體相互作用、細(xì)胞基質(zhì)黏附的調(diào)控以及平滑肌細(xì)胞遷移調(diào)控等重要信號相關(guān)。蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)分析共篩選出兩個(gè)關(guān)鍵基因簇。其中degree值排名前五網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)MMP9,COL1A1,COL3A1,COL1A2,SPP1均聚集于基因簇2,且與胞外基質(zhì)重塑或胞外基質(zhì)-受體相互作用有關(guān),但在HNSCC中的作用研究甚少。進(jìn)一步針對上調(diào)及下調(diào)差異基因的轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析共篩選出14個(gè)轉(zhuǎn)錄因子,其中僅有4個(gè)轉(zhuǎn)錄因子在HNSCC研究中有報(bào)道。Kaplan-Meier Plotter分析顯示6個(gè)轉(zhuǎn)錄因子與HNSCC患者預(yù)后顯著相關(guān),另外4個(gè)轉(zhuǎn)錄因子與預(yù)后的相關(guān)性與患者性別相關(guān)。結(jié)論:本研究綜合多種生物信息學(xué)手段揭示HNSCC發(fā)生發(fā)展的潛在轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò),挖掘該網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵基因簇及節(jié)點(diǎn),并預(yù)測其與患者預(yù)后相關(guān)性,為HNSCC的發(fā)病機(jī)制及潛在治療靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)提供理論依據(jù)。